RAPTOR

Раптор является инновационное программное обеспечение предназначены для точного прогнозирования структуры белка. Она сочетает в себе передовые инструменты анализа в одном интегрированном программном решении и предоставляет три различных метода поточной. Уникальное целое число, программирование оптимизация подход Раптора является наиболее эффективным для нахождения шаблонов структуры мишеней с низким гомологии последовательности и способен генерировать модели высокого качества. Простой в использовании интерфейс и простой для понимания значения E идеально подходят для новичков и экспертов. Прежде всего, интуитивно понятный дисплей на выходе позволяет пользователям понять результаты просто на первый взгляд. Учитывая последовательность белка мишени, если есть гомологичный белок с известной структурой 3D, она может быть найдена с помощью поиска последовательности инструменты, как PSI-BLAST, также представленной в Raptor. Структура цели затем построили из известной структуры; Однако, когда последовательность гомологий не является существенным, т.е. менее 25%, PSI-BLAST не может придумать уверенной хит. В отличие от PSI-BLAST, который просто делает поиск последовательность белка, резьбы, сложить признание, делает использование как гомологии и структура информации. Она сканирует последовательность белка с неизвестной структурой с базой данных известных структур. С помощью функции подсчета очков и проведения анализа совместимости между трехмерных структур и линейных белковых последовательностей, лучший структурного шаблона будут определены, из которых построить структуру последовательности в. В результате, белок резьбы дает превосходную прогноз, чем гомологий моделирования, когда есть предельная гомологии последовательности

Ограничения :.

Ограниченная функциональность